17 июня 1941г. лейтенант Худяков выбыл по болезни из 1-й Высшей школы штурманов ВВС Красной Армии (г.Рязань). в госпиталь ВВС КА. 

В июле 1941г. на базе школы был сформирован 1 дальний разведывательный авиационный полк (командир полка подполковник Сабуров Михаил Дмитриевич).

С 20 июля по 10 сентября 1941г. полк выполнял задания на Северо-Западном, Западном, Юго-Западном и Брянском фронтах, ведя боевую работу с аэродромов подскока.

К декабрю 1941г. часть личного состава полка была направлена в 215 отдельную разведывательную авиационную эскадрилью особого назначения (командир- капитан Берман Семен Давидович, комиссар- старший политрук Артемьев Борис Павлович).

Эскадрилья вела разведку войск противника, наступающих на московском направлении. С декабря 1941г. базировалась на аэродроме Монино (Московская обл.).

26 апреля 1942г. эскадрилья обращена на формирование 4 дальнего разведывательного авиационного полка (командир- майор Берман Семен Давидович, военком- батальонный комиссар Артемьев Борис Павлович). 

09 августа 1942г. экипаж самолета Пе-2: летчик младший лейтенант Буслаков Семен Иванович, штурман звена лейтенант Худяков Михаил Иванович, воздушный стрелок-радист сержант Гришак Денис Иванович, не вернулся с боевого задания.