Родился в 1907 году. Был призван в первые же дни войны 29.06.1941 года Сокольническим  райвоенкоматом города Москвы. С июля 41 года воевал на Ленинградском фронте, в марте 1942 был ранен. После госпиталя вернулся на фронт. С 1943 года воевал на Воронежском, затем на 1-м Украинском фронтах, был сапером-подрывником 2-й Гвардейской инженерно-минной роты 3-ей Гвардейской мотострелковой бригады 4 Гвардейского танкового корпуса. В феврале 1944 года старший сержант Никишин Кирилл Афанасьевич был награжден орденом "За отвагу" за то, что " минировал поля в непосредственной близости от противника, лично установил более 30 противотанковых мин, сделал 2 прохода в минных полях для прохождения наших танков, восстанавливал разрушенные мосты и дороги, что позволяло своевременно проходить по установленному маршруту. 

Погиб в августе 1944 года в Польше. Похоронен в г. Мелец (перезахоронен из Радомысля)