Русский. Из рабочих. Подполковник. В РККА с 1931. Член компартии с 1930. Окончил Автотракторный техникум (1931), Бронетанковую школу (1932), Высшую специальную школу Генштаба Красной армии (1940-1941).

Командир взвода, старший инструктор парка КУКС, командир роты, командир взвода учебного механизированного полка Военной академии механизации и моторизации РККА (1931-1936). В 1934 был в командировке в Турции (как инструктор, при поставке советской воееной техники в эту страну).

Секретарь военного атташе при полпредстве СССР в Литве, в распоряжении РУ РККА (июль 1936 — июль 1940). Воевал в период Советско-Финляндской войны. 

Участник Великой Отечественной войны. С ноября 1941 начальник 3-го отделения РО штаба 20-й армии. «Проявил себя опытным работником, смелым командиром и неутомимым организатором. Выполняя специальные задания, т. Руненко показал свое умение, настойчивость и организаторские способности. К порученным заданиям относится добросовестно, выполняет их инициативно. Во второй половине апреля в сложных условиях организовал подготовку людей для специального задания и добился выполнения намеченного плана » (из Наградного листа, 28.04.1942). Сотрудник 1-го отдела 1-го управления ГРУ. Возглавлял специальную разведывательную группу ГРУ при 3-й гвардейской танковой армии (декабрь 1944 — май 1945). В ее задачу входили сбор и отправка в Центр сведений и документов в интересах предстоящей Берлинской стратегической операции, а также заброска на территорию Германии разведгрупп. Старший помощник начальника 1-го отдела 1-го управления ГРУ Генштаба Красной армии.

Награжден орденами Красного Знамени (1945), Отечественной войны II ст. (1944), медалью «За отвагу» (1942), медалью "За оборону Москвы"